红网时刻新闻8月26日讯(通讯员 张维夏)湖南省人民医院心血管流行病学研究室在临床医学院副院长洪秀琴,心内科主任郑昭芬、副主任潘宏伟的指导下开展基因流行病学研究及心血管大数据挖掘与临床验证工作。6个月完成研究论文6篇,其中5篇发表在国际一流SCI期刊,总影响因子达33.6分。
急性心脑血管疾病的基因及免疫治疗新依据
心血管流行病学研究室团队成员郑鹏飞博士通过采用加权基因共表达网络(WGCNA)技术分析全球公开数据集的基因表达谱和单核苷酸多态性,揭示了1种特征性单核苷酸多态性在调控血脂和冠心病发病中的作用,鉴定了缺血性脑卒中发病中的4种关键基因和急性心肌梗死发病中的2种关键基因,并通过线性支持向量回归技术鉴定了2种关键免疫细胞,阐明了基因差异和免疫浸润在急性心肌梗死和急性脑卒中的作用机制,为急性心脑血管疾病的基因及免疫治疗提供了新的依据。
同时,研究团队还使用拉索回归、随机森林和支持向量机等变量筛选技术,鉴定了两种基因表型,验证了免疫浸润机制在慢性房颤发病中的作用。
全部研究成果整理为5篇原创论著,在国际一流期刊中发表,其中1篇影响因子6.0分(JCR1区),两篇影响因子5.4分(JCR2区),2篇影响因子8.4分(JCR1区)。
研究不断深入,多项目取得突破性进展
心血管基因大数据挖掘属于基因流行病学范畴,其特征是通过网络公开的基因数据进行变量筛选,在消除了混杂因素后,鉴定表达模式相似的基因集合,寻找基因集合与疾病之间的联系,并最终识别出关键调控基因的方法。
湖南省人民医院心血管流行病学研究室团队一直致力于心血管基因流行病学研究和心血管大数据挖掘及验证工作。创建半年以来,指导硕士研究生9名,申报课题4项;团队核心成员谢琼,范文娟,荣晶晶,邹琼超、郑鹏飞等,均熟练掌握了R语言和使用机器学习进行基因筛选的方法,将拉索回归、随机森林、支持向量机等统计学技术应用于心血管大数据挖掘。
目前,团队成员已深入到全基因组关联关系与单核苷酸多态性的研究中,努力探索人群多态性与心血管疾病的因果关系,近期多个项目获得突破性进展,4篇关键论文也正在撰写中。
来源:红网
作者:张维夏
编辑:赵悦杉
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